Podstawy bioinformatyki i montażu genomu: od surowych danych do analizy

Współczesne badania biologiczne opierają się w dużej mierze na danych genomicznych, ale analiza surowych plików sekwencjonowania może wydawać się przytłaczająca dla początkujących.Ten kurs przeprowadzi Cię przez podstawowe etapy przetwarzania danych bioinformatycznych, pokazując, jak przekształcić nieprzetworzone odczyty sekwencji w znaczące zespoły genomu bezpośrednio na standardowym komputerze. Zaczniesz od kluczowej terminologii, uczenia się podstawowych pojęć sekwencjonowania nowej generacji, wskaźników jakości i formatów plików.Dzięki jasnym pisemnym wyjaśnieniom i przykładom obliczeniowym będziesz postępować krok po kroku od pozyskiwania danych do rekonstrukcji genomu. Czego się nauczysz: • Zrozumienie kluczowych formatów danych genomicznych i podstawowej terminologii sekwencjonowania • Pobieranie publicznych zestawów danych sekwencjonowania z otwartych repozytoriów biologicznych • Ocena jakości odczytu i zastosowanie strategii przycinania do czyszczenia surowych danych • Wykonaj montaż genomu de novo za pomocą standardowych narzędzi bioinformatycznych • Ocenić metrykę montażu i ocenić Materiał płynnie przechodzi od podstawowych zasad do pełnych potoków analiz. Zaprojektowany dla biologów, studentów i entuzjastów nauk przyrodniczych, bez konieczności wcześniejszego przygotowania w zakresie bioinformatyki. Zacznij czytać i rozwijaj swoje umiejętności analizy genomu już dziś.