Grundlagen der Bioinformatik und Genome Assembly: Von Rohdaten zur Analyse

Die moderne biologische Forschung stützt sich stark auf genomische Daten. Die Analyse von Rohsequenzdaten kann sich für Anfänger jedoch überwältigend anfühlen. Dieser Kurs führt Sie durch die wesentlichen Schritte der bioinformatischen Datenverarbeitung und zeigt Ihnen, wie Sie unverfeinerte Sequenzwerte direkt auf einem Standardcomputer in aussagekräftige Genom-Assemblies umwandeln können. Sie lernen die wichtigsten Begriffe, die Grundlagen der Next-Generation-Sequenzierung, Qualitätsmetriken und Dateiformate kennen und gehen Schritt für Schritt von der Datenerfassung bis zur Genomrekonstruktion vor. Was Sie lernen werden: • Verstehen Sie die wichtigsten genomischen Datenformate und die grundlegende Sequenzierungsterminologie • Abrufen von öffentlichen Sequenzierung-Datensätzen aus offenen biologischen Repositories • Bewerten Sie die Lesequalität und wenden Sie Trimming-Strategien auf saubere Rohdaten an • Führen Sie eine De-Novo-Genom-Assemblierung mit Standard-Bioinformatik-Tools durch • Beurteilen Sie die Assemblierungsmetriken und bewerten Sie die contig Qualität • Erkunden Sie moderne Workflow-Konzepte für reproduzierbare genomische Forschung. Das Material bewegt sich nahtlos von den Grundprinzipien zu vollständigen Analysepipelines. Entwickelt für Biologen, Studenten und Life-Science-Enthusiasten, für die kein vorheriger Bioinformatik-Hintergrund erforderlich ist.