16S Metabarcoding i analiza metagenomiczna z Galaxy

Zrozumienie złożonego świata społeczności mikrobiologicznych jest niezbędne dla nowoczesnych badań biologicznych i medycznych, ale surowe dane sekwencjonowania mogą wydawać się przytłaczające.Ten kurs tekstowy uczy, jak przetwarzać i interpretować dane 16S rRNA za pomocą Galaxy, potężnej platformy internetowej, która wymaga zerowego programowania. Pod koniec tego kursu przejdziesz od początkującego do pewnego analityka zdolnego do uruchamiania standardowych rurociągów metagenomicznych.Przeczytasz jasne wyjaśnienia, zrozumiesz podstawowe pojęcia biologiczne i nauczysz się interpretować profile taksonomiczne. Co się nauczysz: Zrozumienie podstawowych pojęć sekwencjonowania rRNA 16S, metakodowania i metagenomiki; Nawigacja w interfejsie platformy Galaxy w celu przesyłania danych, uruchamiania narzędzi i zarządzania historią; Wykonaj kontrolę jakości i wstępne przetwarzanie surowych odczytów sekwencje, aby zapewnić wiarygodne wyniki; Klasyfikuj grupy taksonomiczne i porównaj wyniki. Jednostki taksonomiczne (OTU) z nowoczesnymi wariantami sekwencji Amplicon (ASV);Interpretuj wskaźniki różnorodności ekologicznej i wykresy obfitości taksonomii, aby wyciągnąć wnioski biologiczne.Kurs rozpoczyna się od podstawowej terminologii i teorii sekwencjonowania genów markerowych, zanim przeprowadzi Cię krok po kroku przez kompletny rurociąg analizy danych. Nauczysz się konfigurować narzędzia, łańcuchy zadań i rozwiązywać typowe problemy z jakością danych. Ten kurs jest przeznaczony dla początkujących, studentów i badaczy nauk przyrodniczych, którzy chcą analizować dane mikrobiomu bez pisania kodu wiersza poleceń. Rozpocznij swoją podróż w analizie danych mikrobiologicznych i odkryj tajemnice mikrobiomu już dziś.