Évolution Moléculaire et Phylogénétique en Bioinformatique

Comment les scientifiques retracent-ils l'histoire de la vie et découvrent-ils les origines des virus ou des espèces anciennes ? La réponse réside dans l'évolution moléculaire, où nous utilisons des méthodes informatiques pour décoder les relations évolutives cachées dans les séquences d'ADN et de protéines. Ce cours vous guidera à travers les concepts fondamentaux et les algorithmes utilisés pour construire des arbres phylogénétiques et analyser des données moléculaires. Vous passerez de la compréhension des mutations génétiques de base à la reconstruction des histoires évolutives à l'aide de flux de travail modernes de biologie computationnelle. Ce que vous apprendrez : - Comprendre les mécanismes fondamentaux de l'évolution moléculaire, de la duplication des gènes et de la divergence des séquences. - Appliquer des algorithmes basés sur la distance et sur les caractères pour construire des arbres phylogénétiques précis. - Analyser des données génétiques à l'aide de modèles probabilistes, y compris la vraisemblance maximale et les approches modernes d'inférence bayésienne. - Comparer des séquences d'ADN et de protéines à l'aide d'outils d'alignement modernes et de bibliothèques bioinformatiques basées sur Python. - Interpréter des arbres évolutifs pour résoudre des mystères biologiques, tels que le traçage d'épidémies ou l'identification d'ancêtres communs. Vous commencerez par maîtriser la terminologie biologique essentielle et les concepts évolutifs avant de passer à des explications écrites étape par étape des algorithmes de construction d'arbres. Grâce à des explications textuelles structurées et à des exercices écrits, vous vous entraînerez à évaluer des modèles évolutifs et à analyser des données de séquences. Ce cours est conçu pour les débutants en bioinformatique, les étudiants en biologie ou les développeurs de logiciels cherchant à se reconvertir dans la biologie computationnelle, sans nécessiter de connaissances préalables avancées. Commencez votre voyage dans l'histoire des génomes et apprenez à décoder le passé évolutif dès aujourd'hui.